本文主要记录 PyMOL 中的一些命令行操作，PyMOL 的主界面虽然有两个输入指令的窗口，但个人认为 External GUI 里面的指令输入框更为方便，不仅能查看输入的记录，也能在分离出主界面后放大并置于合适的位置进行命令行操作。另外 PyMOL 自带 tab 键补齐的功能，所以 PyMOL 对命令行操作还是比较友好的。
PyMOL 是一款基于 Python 开发的三维结构可视化的软件。个人觉得同 VMD 及 SPDBV 相比，其操作更加简单灵活、图形更加美观，而且可以使用命令行进行批处理，本文主要记录鼠标操作的相关内容。