主要记录在 Ubantu 上使用 Vina 进行分子对接的过程。大致可分为受体配体分子的预处理（MGLTools）和分子对接（Vina）两部分。
本文主要记录 PyMOL 中的一些命令行操作，PyMOL 的主界面虽然有两个输入指令的窗口，但个人认为 External GUI 里面的指令输入框更为方便，不仅能查看输入的记录，也能在分离出主界面后放大并置于合适的位置进行命令行操作。另外 PyMOL 自带 tab 键补齐的功能，所以 PyMOL 对命令行操作还是比较友好的。
PyMOL 是一款基于 Python 开发的三维结构可视化的软件。个人觉得同 VMD 及 SPDBV 相比，其操作更加简单灵活、图形更加美观，而且可以使用命令行进行批处理，本文主要记录鼠标操作的相关内容。
VMD 主要用来可视化化蛋白质三维结构，但是其功能远远限于此，本文只是对一些基本操作进行说明。
本文主要对 SPDBV 的一些简单用法进行讲解，如有更高需求可以去看官网查看相应说明。
有在Linux上安装软件或配置环境的经验，那么把Anaconda称之为神器就不会觉得过分！尤其对于初学者，有兴趣可以自行体会不使用conda安装软件。
写在前面：
- 本文推荐Typora码字，软件安装见
Y01_1_R和Python大礼包（初学必备）.md中Markdown的介绍。 - 本文主要对码字常用Markdown语法进行说明，如标题、目录、强调、换行、图片与链接、引用、代码、和分割线，其他语法详见文末参考资料。
- 本文为了便于快速记忆且不混淆，大部语法只对其中最便于使用的方式进行说明。
本文主要介绍 R 和 Python 安装及一些推荐的 IDE，注意根据实际情况下载最版本的软件。
