本文主要记录 PyMOL 中的一些命令行操作,PyMOL 的主界面虽然有两个输入指令的窗口,但个人认为 External GUI 里面的指令输入框更为方便,不仅能查看输入的记录,也能在分离出主界面后放大并置于合适的位置进行命令行操作。另外 PyMOL 自带 tab 键
补齐的功能,所以 PyMOL 对命令行操作还是比较友好的。
PyMOL 是一款基于 Python 开发的三维结构可视化的软件。个人觉得同 VMD 及 SPDBV 相比,其操作更加简单灵活、图形更加美观,而且可以使用命令行进行批处理,本文主要记录鼠标操作的相关内容。
VMD 主要用来可视化化蛋白质三维结构,但是其功能远远限于此,本文只是对一些基本操作进行说明。
本文主要对 SPDBV 的一些简单用法进行讲解,如有更高需求可以去看官网查看相应说明。